1. CrySPY>
  2. CrySPY Utility
  • 目次

CrySPY Utility

ダウンロードに関してはこちらのページ: Installation/CrySPY utility. 一部のexamplesはこのドキュメントサイトからもダウンロード可能.

目次

  • Examples
    • ase_chgnet_Sr4Co4O12
      • ase_Cu8_RS
        • soiap_Si8_RS
          • soiap_Si8_RS_mindist
            • vasp_Na8Cl8_RS
              • vasp_Sr4O4_RS_pv_term
                • qe_Si8_RS
                  • qe_benzene_2_RS_mol
                    • qe_Sr4O4_RS_pv_term
                      • qe_Si16_LAQA
                      • Scripts
                        • extract_struc.py
                          • pos2pkl.py
                            • kpt_check.py
                              • repeat_cryspy
                                • print_pkl.py
                                CrySPY
                                • Home
                                • CrySPYについて
                                  • 結晶構造探索
                                  • 探索アルゴリズム
                                  • インターフェース
                                  • ロゴ
                                • バージョン情報
                                  • Version 1.3.0
                                  • Version 1.2.5
                                  • Version 1.2.4
                                  • Version 1.2.3
                                  • Version 1.2.2
                                  • Version 1.2.1
                                  • Version 1.2.0
                                  • Version 1.1.1
                                  • Version 1.1.0
                                  • Version 1.0.0
                                  • Version 0.10.3 or earlier
                                • インストール
                                  • 動作環境
                                    • Python
                                    • 構造最適化ソフト
                                    • find_wy (オプション)
                                  • CrySPY
                                    • CrySPY 1.3.0 or later
                                    • CrySPY 1.0.0 -- 1.2.5
                                    • CrySPY 0.10.3 or earlier
                                  • CrySPYユーティリティ (オプション)
                                • チュートリアル
                                  • ランダムサーチ (RS)
                                    • ASE in your local PC
                                    • soiap in your local PC
                                    • VASP
                                    • QE
                                    • OpenMX
                                    • LAMMPS
                                    • External program
                                    • Check cryspy.in
                                    • Script to run
                                    • Firsrt run
                                    • Submit job
                                    • Check results
                                    • Append structures
                                    • Analysis and visualization
                                    • Load external data
                                  • Evolutionary Algorithm (EA)
                                  • Bayesian Optimization (BO)
                                  • LAQA
                                  • Molecular crystal structure prediction
                                  • Random structure generation with MPI
                                • 探索アルゴリズム
                                  • LAQA
                                • 構造生成
                                  • struc_mode = crystal
                                  • struc_mode = mol
                                  • struc_mode = mol_bs
                                • 機能
                                  • Logging
                                  • バックアップ
                                  • クリーン
                                  • Restriction on interatomic distances
                                  • ジョブファイルのCrySPY_ID
                                  • MPI並列化を用いた構造生成
                                  • Enthalpy
                                  • As library
                                • 入力ファイル
                                  • File format
                                  • [basic] section
                                  • [structure] section
                                  • [VASP] section
                                  • [QE] section
                                  • [OMX] section
                                  • [soaip] section
                                  • [LAMMPS] section
                                  • [ASE] section
                                  • [EA] section
                                  • [BO] section
                                  • [LAQA] section
                                  • [option] section
                                  • Kpoint
                                • データフォーマット
                                  • Common data
                                    • Initial and optimized structure data
                                    • Result data
                                  • Random Search (RS)
                                  • Evolutionary algorithm (EA)
                                  • Bayesian Optimization (BO)
                                  • LAQA
                                  • オプションデータ
                                    • Energy step data
                                    • Structure step data
                                    • Force step data
                                    • Stress step data
                                • CrySPY Utility
                                  • Examples
                                    • ase_chgnet_Sr4Co4O12
                                    • ase_Cu8_RS
                                    • soiap_Si8_RS
                                    • soiap_Si8_RS_mindist
                                    • vasp_Na8Cl8_RS
                                    • vasp_Sr4O4_RS_pv_term
                                    • qe_Si8_RS
                                    • qe_benzene_2_RS_mol
                                    • qe_Sr4O4_RS_pv_term
                                    • qe_Si16_LAQA
                                  • Scripts
                                    • extract_struc.py
                                    • pos2pkl.py
                                    • kpt_check.py
                                    • repeat_cryspy
                                    • print_pkl.py
                                • FAQ
                                  • シミュレーションの途中でnjobを変えることはできますか?
                                リンク
                                • GitHub repo
                                • GitHub discussions
                                • CrySPY utility

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