<?xml version="1.0" encoding="utf-8" standalone="yes"?><rss version="2.0" xmlns:atom="http://www.w3.org/2005/Atom"><channel><title>初期構造の読み込み :: CrySPY document</title><link>https://tomoki-yamashita.github.io/CrySPY_doc/ja/features/load_struc/index.html</link><description>最終更新日：2026年10月16日&#10;あらかじめ用意した構造を，探索の初期構造として使用できる． cryspy.inの[option]セクションでload_struc_flag = Trueを指定すると，初回起動時に./data/pkl_data/init_struc_data.pklを読み込む．デフォルトはFalse． 必要な構造数に満たない場合は，不足分をランダム生成で補完する．&#10;使い方 [option] load_struc_flag = True cifファイル3つからデータを作成して読み込む手順は，チュートリアル &gt; 初期構造の読み込みを参照． 構造ファイルからinit_struc_data.pklへの変換には，CrySPY Utilityのpos2pkl.pyを使用できる．&#10;読み込み時のチェック 読み込み時には以下の条件を確認する．条件を満たさない場合はエラーになり，初期化を停止する．&#10;init_struc_data.pklのデータが辞書であること． 構造IDが整数の0から始まる連番であること．例えば，3構造なら0，1，2． 各構造データがpymatgenのStructureであること． 構造数が以下の上限を超えないこと． アルゴリズム 構造数の上限 EA，EA-vc n_pop RS，BO，LAQA tot_struc データ形式の詳細はデータフォーマット &gt; 初期構造と最適化後の構造データを参照．&#10;原子種・原子数・組成のチェック RS，BO，LAQA，EAでは，原子種と各原子種の原子数がatypeとnatの設定に一致する必要がある．同じ組成比でも，原子数が異なる構造は使用できない．&#10;EA-vcでは，以下の条件を確認する．&#10;項目 条件 原子種 atype以外の原子種を含まない． 原子数 各原子種の原子数がll_natからul_natまでの範囲内にあり，構造全体で1個以上の原子を含む． 組成制限 min_compやmax_compを指定した場合は，その組成範囲を満たす． 電荷中性条件 chargeを指定した場合は，指定した価数の組合せで電荷中性条件を満たせる． 組成制限と電荷中性条件の詳細は，組成制限および電荷中性条件を参照． 読み込み時には，mindistや空間群，セル体積の制限はチェックしない．</description><generator>Hugo</generator><language>ja</language><atom:link href="https://tomoki-yamashita.github.io/CrySPY_doc/ja/features/load_struc/index.xml" rel="self" type="application/rss+xml"/></channel></rss>