CrySPY 1.0.0 -- 1.2.5

CrySPY

pip

CrySPY 1.0.0以降はpipを使ってインストール可能になった．

pip install csp-cryspy

pipでインストールすると，実行スクリプトのcryspyが自動的にPATHが通ったところにインストールされる． 下記コマンドでチェックできる．

which cryspy

編集可能モード

CrySPYのソースコードを編集したい時は，pipの編集可能モード（-e オプション）を使うのが便利．

git clone https://github.com/Tomoki-YAMASHITA/CrySPY.git
pip install -e ./CrySPY

git cloneの代わりに，release pageから圧縮ファイルをダウンロードしてもよい．

cal_fingerprint (Optional)

cal_fingerprintプログラムは構造記述子を計算するためのもので，アルゴリズにベイズ最適化を使う場合は必須． CrySPY 1.0.0からはcal_fingerprintプログラムはCrySPY utilityに含まれている． コンパイルについてはこちらを参照：Instllation/CrySPY_utility/Compile cal_fingerprint．

実行ファイルcal_fingerprintをPATHが通ったところに置く，もしくは下記のようにcryspy.inで実行ファイルのpathを指定する．

[BO]
fppath = /xxx/xxx/xxx/cal_fingerprint

Arm64 on MacOS (Without Rosseta 2)

情報

PyXtalではversion 0.6.3からpyshtoolsが必須ではなくなったので，最近のバージョンのpyxtalを使う場合は以下に書いてあることは無視して良い

  1. miniforge3をインストール（homebrew pythonでpyshtoolsをインストールする方法が今のところ不明）
  2. condaでpymatgen，pyshtoolsをインストール（最近のバージョンのpyshtoolsはconda-forgeからインストール可能になった）
conda install pymatgen
conda install pyshtools
  1. CrySPYをインストール
pip3 install csp-cryspy