CrySPYユーティリティ (オプション)

ローカルPCにPython環境を構築しておくと，計算結果の解析および可視化を行うのに便利である． jupyter notebookやPythonスクリプトなどのユーティリティツールが利用できる． 入力ファイルのexamplesもCrySPYユーティリティに含まれている．

ユーティリティツールを使うには以下のライブラリ等が必要になる．

• jupyter
• NumPy
• pandas
• matplotlib
• pymatgen

ユーティリティツールのダウンロード

Git

$ git clone https://github.com/Tomoki-YAMASHITA/CrySPY_utility.git

zip

CrySPY utilityへ飛んで，緑のCodeと書かれたボタンをクリック，Download ZIPを選んでダウンロード.

Compile cal_fingerprint

ベイズ最適化を使うときは構造記述子を計算するためのcal_fingerpirntプログラムをコンパイルする． Fortranコンパイラが必要になる． ワークステーションやスパコンなどのCrySPYを用いる環境にインストールする．

cd CrySPY_utility/f-fingerprint
emacs Makefile
make

実行ファイルの扱いに関してはInstallation/CrySPYも参照.