1. CrySPY>
  2. 探索アルゴリズム
  • 目次

探索アルゴリズム

目次

  • Random search (RS)
    • 進化的アルゴリズム (EA)
      • Crossover
        • Permutation
          • Strain
            • トーナメント選択
              • ルーレット選択
              • 組成可変型進化的アルゴリズム (EA-vc)
                • Crossover (vc)
                  • Addition
                    • Elimination
                      • Substitution
                      • Bayesian optimizaion (BO)
                        • LAQA
                          CrySPY
                          • Home
                          • バージョン情報
                            • Version 1.4.0
                            • Version 1.3.0
                            • Version 1.2.5
                            • Version 1.2.4
                            • Version 1.2.3
                            • Version 1.2.2
                            • Version 1.2.1
                            • Version 1.2.0
                            • Version 1.1.1
                            • Version 1.1.0
                            • Version 1.0.0
                            • Version 0.10.3 or earlier
                          • インストール
                            • 動作環境
                              • Python
                              • 構造最適化ソフト
                              • find_wy (オプション)
                            • CrySPY
                              • CrySPY 1.3.0 or later
                              • CrySPY 1.0.0 -- 1.2.5
                              • CrySPY 0.10.3 or earlier
                            • CrySPYユーティリティ (オプション)
                          • チュートリアル
                            • ランダムサーチ (RS)
                              • ASE on your local PC
                              • soiap on your local PC
                              • VASP
                              • QE
                              • OpenMX
                              • LAMMPS
                              • Check cryspy.in
                              • Script to run
                              • Firsrt run
                              • Submit job
                              • Check results
                              • Append structures
                              • 解析と可視化
                            • 進化的アルゴリズム(EA)
                              • ASE on your local PC
                              • 次世代の生成
                              • 結果の確認
                              • 解析と可視化
                            • 組成可変型進化的アルゴリズム(EA-vc)
                              • ASE on your local PC (Cu-Ag-Au)
                              • ASE-CHGNet(Cu-Au)
                              • 次世代の生成
                              • 結果の確認
                              • 解析と可視化
                            • Bayesian Optimization (BO)
                            • LAQA
                            • Molecular crystal structure prediction
                            • Random structure generation with MPI
                            • インタラクティブモード (Jupyter Notebook)
                          • インターフェース
                          • 探索アルゴリズム
                            • Random search (RS)
                            • 進化的アルゴリズム (EA)
                              • Crossover
                              • Permutation
                              • Strain
                              • トーナメント選択
                              • ルーレット選択
                            • 組成可変型進化的アルゴリズム (EA-vc)
                              • Crossover (vc)
                              • Addition
                              • Elimination
                              • Substitution
                            • Bayesian optimizaion (BO)
                            • LAQA
                          • 構造生成
                            • struc_mode = crystal
                            • struc_mode = mol
                            • struc_mode = mol_bs
                          • 機能
                            • Logging
                            • バックアップ
                            • クリーン
                            • 原子間距離の制限
                            • ジョブファイルのCrySPY_ID
                            • MPI並列化を用いた構造生成
                            • Enthalpy
                            • As library
                            • Interactive mode
                          • 入力ファイル
                            • File format
                            • [basic] section
                            • [structure] section
                            • [VASP] section
                            • [QE] section
                            • [OMX] section
                            • [soaip] section
                            • [LAMMPS] section
                            • [ASE] section
                            • [EA] section
                            • [BO] section
                            • [LAQA] section
                            • [option] section
                            • Kpoint
                          • データフォーマット
                            • Common data
                              • Initial and optimized structure data
                              • Result data
                            • Random Search (RS)
                            • Evolutionary algorithm (EA)
                            • Bayesian Optimization (BO)
                            • LAQA
                            • オプションデータ
                              • Energy step data
                              • Structure step data
                              • Force step data
                              • Stress step data
                          • CrySPY utility
                            • repeat_cryspy
                            • extract_struc.py
                            • print_pkl.py
                            • pos2pkl.py
                            • kpt_check.py
                          • FAQ
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                          リンク
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                          • CrySPY utility

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