解析と可視化
最終更新日：2026年10月16日
自動エネルギープロット
バージョン1.4.4からは，デフォルトで各世代の計算終了時に自動的にエネルギープロットが行われ， ファイルは下記に保存される．
./data/energy_plot/energy_EA_gen_{gen}.{fig_fotmat}.
バージョン1.5.0以降は，[option]セクションのenergy_output_intervalで出力間隔（世代数）を変更できる．デフォルトは1（毎世代）で，0なら自動出力を無効にする．詳細は入力ファイル > [option] Sectionを参照．
cryspy.inの[visual]セクションで以下の入力変数が指定可能となっている．
入力変数の詳細はこちら CrySPY > Input file > [visual] section.
cryspy-Eplotを用いた再プロット
もしプロットされた図を調整して再プロットしたい場合は，cryspy-Eplotコマンドを使えば簡単に実行できる．
cryspy-Eplotコマンドを用いる場合は，専用の以下の入力変数も利用可能となっている．
plot_min_genplot_max_genref_gen
例えば，2世代目における図を再プロットするには，[visual]セクションを下記のように書く．
cryspy-Eplotを実行すると
この場合，CrysPYは ./data/energy_plot/energy_EA_gen_{gen}.{fig_fotmat}にファイルを上書き保存する．
plot_min_genとplot_max_genを用いることで，プロットする世代の範囲を指定することも可能である．
plot_min_genに値が設定された場合，たとえそれが1であっても普段と異なる次のファイルに図が保存される．
./data/energy_plot/energy_EA_gen_{plot_min_gen}-{plot_max_gen}.{fig_fotmat}．
例えば，第2世代時点での結果から，2世代目だけの結果を抜き出すには下記のように行う．
どの時点での世代の結果を用いるか（x軸の最大値に関係）は，ref_genで指定できる．
例えば，ページ最上部の図にあるように，第3世代までの結果から，第2世代目の結果だけ抜き出すには，以下のように設定する．
ref_genが指定されている場合は，ファイル名は以下のようになる．
energy_EA_gen_{plot_min_gen}-{plot_max_gen}_ref_{ref_gen}.{fig_format}．
より詳細なデータ解析や，図の編集がしたければ，次に書いてあるようにファイルをダウンロードしてJupyter notebookを使うと良い．
データのダウンロード
ここでは，CrySPYのデータをローカルPCで解析・可視化することを前提としている．
CrySPYをスーパーコンピュータやワークステーションで使用している場合は，データをローカルPCにダウンロードすること．
work や backup ディレクトリは，ファイルサイズが非常に大きくなる可能性があるため，不要であれば削除してよい．
Jupyter Notebook
先ほどダウンロードした結果の中にある data/ ディレクトリに移動する．
その後，CrySPY utilityがローカルにダウンロード してある場合は cryspy_analyzer_EA.ipynb をコピーする．
またはGitHubから直接ダウンロードしてくる（CrySPY_utility/notebook/）．
Jupyter を起動し（VScode，Jupyter Lab，Jupyter Notebook など），
セルを順番に実行するだけで，以下のような図を得ることができる．
