Check cryspy.in
2025年6月16日 更新
詳細は 入力ファイルのページも見ること.
cryspy.in
をもう一度チェックしてみよう.ここでの例は選んだcalc_code
に応じて,準備したものと少し異なるかもしれない.
[basic]
algo = RS
calc_code = ASE
tot_struc = 5
nstage = 1
njob = 5
jobcmd = zsh
jobfile = job_cryspy
[structure]
atype = Cu
nat = 8
[ASE]
ase_python = ase_in.py
[option]
[basic] section
algo
: アルゴリズム.ランダムサーチの場合はRS
を使う.calc_code
: 構造最適化のコード.VASP
,QE
,OMX
,soiap
,LAMMPS
,ASE
から選択.tot_struc
: 構造数.この場合初回実行で5構造ランダムに生成される.nstage
: ステージ数njob
: 同時にサブミットするジョブの数.この例では2つのスロットを設定,言い換えると,2構造ずつ最適化を行う.jobcmd
: ジョブを実行または投入するコマンド.bash
,zsh
,qsub
などjobfile
: ジョブファイルのファイル名
[structure] section
atype
: Atom type. Na8Cl8の例:atype = Na Cl
.nat
: atypeに応じた原子数. Na8Cl8の例:nat = 8 8