Check cryspy.in

2025年6月16日 更新

詳細は 入力ファイルのページも見ること.

cryspy.inをもう一度チェックしてみよう.ここでの例は選んだcalc_codeに応じて,準備したものと少し異なるかもしれない.

[basic]
algo = RS
calc_code = ASE
tot_struc = 5
nstage = 1
njob = 5
jobcmd = zsh
jobfile = job_cryspy

[structure]
atype = Cu
nat = 8

[ASE]
ase_python = ase_in.py

[option]

[basic] section

  • algo: アルゴリズム.ランダムサーチの場合はRSを使う.
  • calc_code: 構造最適化のコード. VASP, QE, OMX, soiap, LAMMPS, ASEから選択.
  • tot_struc: 構造数.この場合初回実行で5構造ランダムに生成される.
  • nstage: ステージ数
  • njob: 同時にサブミットするジョブの数.この例では2つのスロットを設定,言い換えると,2構造ずつ最適化を行う.
  • jobcmd: ジョブを実行または投入するコマンド. bash, zsh, qsubなど
  • jobfile: ジョブファイルのファイル名

[structure] section

  • atype: Atom type. Na8Cl8の例: atype = Na Cl.
  • nat: atypeに応じた原子数. Na8Cl8の例: nat = 8 8